5000 gp är ungefär korrekt för ett objekt som behandlar 1d4 skada varje runda.
Det närmaste riktmärket jag kan hitta är Horned Helm (Magic Item Compendium, 8000 gp) som ger en sekundär gore attack (-5 attack) som hanterar 1d8 plus en halv styrka modifierare skada.
Denna ioun-sten är i huvudsak en svagare version av den föremålet. Det handlar om hälften så mycket skada, låter dig inte välja mellan flera mål och träffar angränsande allierade (fastän allierade sällan kommer att angränsas till detta om du inte läker dig, så det är inte lika starkt en nackdel som det kan tyckas). På uppsidan är det slotlöst. Det använder den fullständiga basattacken i stället för -5, men eftersom den använder mentala betyg är den svagare på ett melee-tecken, och en spellcaster är sällan i melee, så den aspekten balanserar sig.
Så 5.000 gp är runt rätt pris för det här objektet. För att förhindra att någon bär flera av dessa för att bli en mänsklig motorsåg, föreslår jag att sådana stenar försöker attackera varandra när många bärs på en gång.