Ignorerar för tillfället hela frågan om hur en replikator skulle fungera i den verkliga världen (det här är fiktion trots allt), problemet med latina inte är replikabelt är inte trivialt.
Vi har fått höra att replikatorer inte kan hantera vissa typer av radioaktiva material - vilket gör en viss mening eftersom materialet som replikeras skulle ändras kontinuerligt - förutom det är ett argument för varför vissa material inte kan transporteras . Det skulle också innebära att latinus fördröjer ständigt till någonting annat - och det skulle göra det till en fruktansvärd form av valuta.
Hela problemet stammar från ett kärnproblem med ST-vetenskapen - författarna verkar inte fullt ut förstå vad som är ett element, en kemikalie, en subatomisk partikel och så vidare (få mig inte igång på den fasansfulla dumma omega partikelskräp introducerad i Voyager - eller värre, "röd sak" i den första nya ST-filmen ... Ett kemiskt sätt att skapa svarta hål? Verkligen?).
Latinum verkar vara ett element (som guld). Faktum är att det måste vara av reduktion: om det är en kemikalie, det är gjort av element och vi är tillbaka till element (samma argument för legeringar eller amalgamer). Det innebär då att det finns ett icke-radioaktivt element som inte kan replikeras.
Thing är - oavsett hur komplex (som bara kan betyda "stor") en atom får, den kommer att fungera på principerna för kvantmekanik som är förutsägbara. Varje process som kan ta energi och väsentligen klämma den i elektroner och kvarkar och sedan limma kvarker tillsammans för att göra protoner och neutroner, kommer redan att ha mer än tillräckligt med kraft och precision för att göra någon atom, oavsett hur komplex.
Sooooo ... @ neilfien svar är i grunden död på, och @ BBlakes svar har orsaken.
@ Jeffs svar medan tekniskt korrekt sätter vagnen inför hästen och det är inte så mycket att svara på frågan som rättfärdigande det. :)