När Equinox-doktorns etiska subrutiner raderas kan han göra alla sorters saker som han normalt inte skulle göra, som att döda främmande livsformer för att göra dem till bränsle. Jag förstår dock inte varför hans lojalitet mot sin kapten och besättning är så stark oavsett om han är på Equinox eller Voyager. Detta visar sig i hans räddning av kapten Ransom och besättningsmedlemmar från Voyagers brig och hans upprepade subterfuge-kommunikation med Equinox för att varna dem till Voyagers vistelseort och sköldfrekvenser.
När Voyagers doktor har borttagit sina etiska subrutiner ser han emellertid inte ut att analysera eller praktisera sätt att kringgå Kapten Ransoms order att rädda hans besättningsmedlem, Seven of Nine, varken genom förseningar inte heller bedrägeri. Han verkar helt enkelt följa alla kapten Ransoms beställningar.
Jag kan förstå att EMH vill behålla sig först och främst när dess etiska subrutiner tas bort, men varför skulle det då äventyra sin säkerhet på Voyager genom att hjälpa Equinox? Vad bestämmer EMHs lojalitet?