Jag ska fortsätta och ta en sticka för att svara på detta, även om frågan är lite vag. Jag antar att "cook" menar "laga mat med en mikrovågsmetod", som att koka, ånga, baka, steka, sauteeing eller något annat.
Först och främst nej, jag kan inte tänka på någon anledning till varför mikrovågor skulle vara värre än någon annan matlagningsmetod. Om du helt lagar mat i en mikrovågsugn, är det lika säkert att du helt matar det på annat sätt. Om maten når samma temperaturer och hålls där under samma tid, kommer bakterierna att vara lika döda, oavsett vad värmekällan är. Värmen som matas av en mikrovågsugn är ganska lik den som levereras genom ångning, och ingen hävdar att ångkokning är en osäker matlagningsmetod. Det enda jag kan tro att skulle vara osäkert är om du inte helt lagar maten helt, men värm den bara till den temperatur som du vill äta den på. Men det skulle vara ett problem för alla matlagningsmetoder. Farligt underkokt kött är farligt på grund av temperaturen, inte matlagningsmetoden. (Och naturligtvis behöver inte allt mat tillagas för att vara säkert.)
Argumenten du föreslår gör inte heller stor betydelse för mig heller. För det första har jag ingen aning om vad du menar med värmefrekvens eller i följd olika vågor; värme är inte en våg, så jag är inte säker på hur man svarar. Oavsett hur du lagar mat, överförs värme till maten. Värme som orsakas av mikrovågsugns absorption skiljer sig inte från värme som erhålls genom kontakt med kokande vatten, ånga, panna eller varmluft i en ugn. Det är fortfarande värmeöverföring, och det gör att temperaturen går upp. Olika metoder kan värmas mer eller mindre jämnt, eller med olika hastigheter, men värmen är värme.
Vad gäller ditt andra förslag, reflektion av mikrovågor, ja, det händer redan. Du kanske har märkt att maten i en mikrovågsugn hamnar varmt på alla sidor; Detta är särskilt märkbart om det är en stor fast matbit som en gryta. Det blir varmt på toppen, botten och sidorna. Mikrovågorna reflekteras runt; Det finns verkligen inget annat sätt att det ska vara. Om de inte reflekterades skulle de antingen vara absorberade (vilket betyder att din mikrovågsugn skulle värma upp sig) eller passera genom väggarna (vilket betyder att stående bredvid en mikrovågsugn skulle vara farlig). Och det skulle vara fruktansvärt ineffektivt, på toppen av det.
Naturligtvis är alla saker om reflektion och uppvärmning från alla håll fortfarande en viktig punkt när det gäller livsmedelssäkerhet. När du lagar mat i en panna på kaminen, så länge du helt lagar det, är det bra, även om det bara värms upp från botten. Allt som händer är den temperatur maten når.