Jag misstänker att AI används i skeppsdatorer, bara en mycket lägre nivå. När någon säger "Dator, kör en nivå 3-diagnostik på [stort komplext delsystem]" och datorn återvänder ögonblick senare med ett svar går det sannolikt inte helt enkelt igenom en statisk lista över saker att kontrollera och eftersom det aktuella objektet är som ofta används under diagnosen, måste den dynamiskt anpassa rutinerna, flytta och reroutera aktiva användningar runt så att det kan kontrollera allt utan att störa användningen.
Högre nivå AI som hade kommando- och kontrollmöjligheter skulle ha varit problematiska, även om de inte var inneboende onda. Starship kaptener gillar att kontrollera sitt skepp, inte rådfråga det.
Men även ett enkelt kommando som beställts av en besättningsmedlem kommer sannolikt att kräva mycket avancerad beslutsfattande för att slutföra ordern när man använder tillgängliga resurser som delas med andra besättningsmedlemmar runt ombord.
Även den sökfunktion som datorn självklart har i sin gigantiska databas visar att den har signifikant AI-kapacitet för att inte bara hitta relevant information baserad på sammanhang, men att sammanfatta den inom en 10 sekunders scen.
Starships har AI, inte precis som du kanske tänker.
Du kan säga att ett rymdskepp är smartare än en typisk intelligens, men det har inga känslor, inget samvete och ingen självbestämmande. Jag misstänker vad du verkligen frågar är varför inte federationen ger intern motivation eller egen vilja till skepp, och svaret är att Starfleet har valt att inte skapa artificiellt liv som en fråga om politik.