Det finns ingen anledning att det borde vara ett problem. När det gäller Tyskland / Schengenområdet måste du ha visum som är giltigt när du passerar gränskontrollcentralen, i München flygplats, inte tidigare.
Flygbolaget kommer också att kontrollera att du har visum, men det är inte egentligen ett separat krav, bara en annan bekräftelse att du uppfyller kraven i ditt destinationsland (eftersom de kan bötas om de inte ger personer utan visum till gränspunkten ). Eftersom din hustru visum faktiskt skulle vara giltig när hon behöver det, borde de förhoppningsvis förstå att det är bra.