Jag vet inte exakt vad det gäller citrus - om en viss kombination av proteiner, eteriska oljor, massor av små partiklar eller något annat - men enligt min erfarenhet är detta vanligt för många citrusfrukter. Det verkar vara en allmän egenskap att de fånga gasbubblor mycket effektivt, vilket leder till skum. Citrus skumar imponerande när det är uppvärmt, skakat eller kolsyrade, och det hjälpte nog inte med att din sirap skulle ha varit ganska viskös.
Jag föreslog i ett annat svar om överdriven skumbildning som minskar värmen kan minska mängden gas som flyr från lösningen , och därmed minska skumning. (Detta rekommenderas också i marmeladrecept från @Debbie i kommentarer.) Men jag misstänker att detta skulle sakta eller störa med dina försök att nå en mjukbolls konsistens.
En annan sak som hjälper till är att klargöra - att ta bort små partiklar verkar minska citrusns tendens att skumma. Det finns flera metoder som används av ledande bartenders för att klargöra juicer för karbonering, det enklaste av vilket är filtrering. Du kan köra din juice genom ett fint kaffefilter, vilket skulle ta ett tag men vara lätt att göra för små mängder hemma. Om du vill få verkligen seriöst om det, kan du också prova något som agar förtydligande ... men det är nästan säkert överkill för ett spontant beslut att använda en extra 50 g juice. Kanske om du producerar detta på kommersiella skalor ...
Skumningen kommer i alla fall inte att förstöra din sirap. Eventuella effekter på grund av ojämn uppvärmning kommer sannolikt att komma ut i tvätten av andra faktorer, såsom de tillsatta proteinerna och syrorna i saften. Att använda en längre pott och omrörning väl är förmodligen de enklaste sätten att hantera detta som en mindre irritation, om du inte behöver en mer stringent lösning för att arbeta i större mängder.