Nej, det är fortfarande användbart i standard Super Saiyan-form.
Medan det sällan ses efter att han har uppnått Super Saiyan-form använder Goku faktiskt kaio-ken i super saiyanform i den andra världsturneringen mot Pikkon. Eftersom Goku inte är begränsad när han är död på samma sätt är han i livet - han är redan död, så han är inte i fara att dö på grund av kaioken, och han kan utöva mycket mer kraft, som han senare förklarade när han förvandlade sig till Super Saiyan 3-formuläret - det är troligt att detta är nyckeln till att han kan kombinera super saiyan form och kaioken tekniker.
Det är viktigt att notera att den andra världsturneringen är en anime-only filler båge, men blev framkallad i Super, och kan därmed vara inom Akira Toriyamas kanon.