Jag tror att med informationen till hands kan vi säkert kalla den här ett mysterium, eller en olösen delplot (pseudo-plot kanske).
Så de främsta misstänkta är
1 Sifo Dyas
2 Count Dooku
3 Sheev Palpatine
självklart visste Obi Wan Sifo Dyas eller visste åtminstone om honom (för att reläera nyheter om hans passerar till kaminoerna). Lama Su verkade säkert ha haft personliga kontakter med Sifo Dyas, men var Sifo Dyas Obi Wan visste (eller visste av) samma som den som Lama Su hade kontakt med? Vi vet aldrig.
Det är möjligt att en annan person reste till Kamino under Sifo Dyas identitet, var detta kopplat till den verkliga Sifo Dyas döden? igen, ett mysterium.
Medan tidslinjen för Dooku placerar honom som en Sith före ordningen att en klonarmé placeras med kaminoerna är det uppenbart att han hade något engagemang i projektet, åtminstone perifert, som Jango Fett säger att han rekryterades "av en man som heter Tyrannus "(Darth Tyrannus är Sith-namnet på Count Dooku), om vi ska ta Fett efter hans ord, var Count Dooku involverad åtminstone perifert i rekryteringen av en individ som skulle klonas, vilket gör honom själv minst medvetna om projektet.
Hans överraskning vid klon arméns utseende kunde vara att han visste att de fanns, men han visste inte Jedi och republiken visste också, så han blev förvånad över att Jedi / Republiken hade upptäckt och rekryterat klonstyrkor, mer än det faktum de fanns.
Det var också möjligt att det fanns en viss överlapp när det gäller Dooku: s engagemang i både Jedi-ordern och Sith, från början av Ep II, Dooku anses ovanligt misstänkt av Jedi-ordern, speciellt för försöken på Padme Amidalas livet, förmodligen när han lämnade Jedi-ordern, fick han likvärdigt en ansvarsfull ansvarsfrihet, medan han fortfarande var en del av Jedi-ordningen, är det inte otänkbart att han redan hade blivit involverad i Sith och fungerade skadligt inom Jedi ordning i hemlighet.
Förmodligen fanns inga bevis på hans spionage avslöjade, så att han kunde lämna Jedi-ordern med sitt rykte intakt och höll på något sätt av rådet av själva ordern.
Med tanke på den kända kopplingen mellan Fett och Dooku, (de hade tydligt träffat före sitt skärmmötet om Geonosis) antyds det starkt att Dooku var faktiskt bakom försöken på Padme Amidalas liv, med hjälp av Fett som intermediär (som i sin tur använde Zam Wessel).
Dooku hade både direkt tillgång till templet och arkiverna i Jedi (Palpatine gjorde inte), och tidigare kunskap om kloningsprojektet, vilket gjorde honom till en mycket stark misstänkt faktiskt för rekordets manipulation, om huruvida han fungerade som Jedi Dooku, eller Sith Tyrannus, är det mycket osannolikt att hans medverkan inträffade utan kunskap eller medkänsla av Sheev Palpatine aka Darth Sidious.
Som en Sith-lärling skulle Dooku / Tyrannus vara uppdrag att genomföra order från Master Sith. Det verkar som om initiativet inte uppmuntras i Sith-cirklarna, så om vi antar att Dooku / Tyrannus var involverad eller ansvarig (ett ganska säkert antagande) följer det logiskt att han agerade på order eller instruktioner av Palpatine / Sidious.
Jag föreslår att planen själv troligen härstammar från Palpatine / Sidious, med den faktiska uppfattningen att den görs av Dooku / Tyrannus, med hjälp av rekryterade assistenter, som Jango Fett.
Den större frågan är varför? Om Palpatine hade för avsikt att undertrycka republiken och införa sitt eget militära imperium på sin plats, skulle han kräva en militär för att genomdriva den övergången, han skulle också kräva att den hålls omslagen för att inte avslöja sin hand för tidigt, han skulle också kräva en militär kris för att rättfärdiga den här militärens avtäckning utan att orsaka larm och upphävande av befintliga kontroller och saldon inom Galactic senatet som begränsar kanslerens befogenheter, allt han uppnådde (med Dooku's hjälp).
Så jag tror att det är säkert att anta att det är Dooku fingeravtryck kvar på brottsplatsen, men Palpatine var hjärnan och drivkraften bakom det hela.
Skulle det räcka för att få en övertygelse i en domstol? Tja, med tanke på Republiken domstols rekord med Nute Gunray, verkar det osannolikt.