Jag tror att du säger att du har två zoner på en panna, som matas av egen pump och termostat (det vill säga radiatorerna har omvandlats till varmt vatten). Mitt svar är baserat på detta antagande.
Eftersom de båda är på samma panna, värms vattnet med samma bränsleeffektivitet.
De två slingorna är förmodligen olika i hur effektivt de överför den värmen till rummet. Låg effektivitet vid överföring av värme till rummet kommer att minska värmekapaciteten hos din panna, vilket är ett problem om du inte kan få huset tillräckligt varmt på en kall natt. Men så länge du håller på med värmeefterfrågan, skiljer effektiviteten vid överföring av värme inte skillnad med bränsleanvändningen. (Du kan berätta hur effektiv de är för att överföra värme till rummet genom att känna temperaturen i slutet av slingan - om det är ganska kallt, värmen överfördes till rummet mycket bra).
Så, svaret är att du bör ställa termostaterna till lägsta temperatur där du är bekväm. Din tillägg från 2000 har sannolikt mycket mer isolering än det ursprungliga 1939-huset (år 2000 krävde byggkoden mycket isolering, 1939 inte så mycket), så om du vill välja den mer effektiva för att värma, värma tillsatsen inte huvudbyggnaden. Det blir mer effektivt eftersom du kommer att förlora mindre värme på grund av större isolering.