Jag tror att detta nämndes i serien väldigt vagt. Jag kommer inte ihåg den exakta årstiden / episoden, men när Helo frågade Athena hur kunde det vara möjligt sa hon något som samma modeller delade samma minnen och det här är hur de känner igen varandra när de ser sig själva (eller varandra) i en trång plats (full av cyloner).
En liknande version av detta hände mellan Dr. Gaius Baltar och en annan Modell 6 som fångades i Battlestar Pegasus. Hon hade minnen men hon var inte kär i Baltar.
För att undvika förvirringen är varje cylon annorlunda i sina egna liv och minnen, men de delar på något sätt denna kunskap. Det är som att de kan hämta de relaterade minnena när de behöver dem, från ett moln.
EDIT: Om Athena-Tyrol scenen i säsong 2 - Episod 6 - Del 2
The pregnant Sharon Valerii again shows that she has the memories of the 'original' Boomer, which was previously shown in the season opener when she started to tell Starbuck of the time they met. She also displays this in "Home, Part II" where she tells Tyrol she has some of Boomer's memories of him and in "Scar" where she displays some of Boomer's memories of Starbuck to the other's obvious discomfort. - Source
Om Athena-Helo (KAN INTE HÄR HÄR HÄR EPISODE)
Sharon is able to impersonate Lieutenant Valerii convincingly, since she has accessed Valerii's memories at least up until the point of Helo being left behind on Caprica (TRS: "Flesh and Bone", "Scattered", "Home, Part II", "Flight of the Phoenix", "Scar"). - Source