Två orsaker: ålder och fart.
Höga bypass turbofans har bara funnits sedan 70-talet - B-52 var ett av de första massproducerade jet-powered militära flygplanen, och turbofans var helt enkelt inte vid den tiden. Samma för U-2.
Många stridsflygplan går supersoniskt, och jetmotorns drivkraft T definieras som $ T = \ dot {m} \ cdot (V_e - V_0) $, med $ V_0 $ flyghastigheten. Avgashastighet $ V_e $ måste vara högre än sann flyghastighet för att generera tryckkraft och turbojets har en mycket högre avgasflödeshastighet än turbofans kalla ström.
Pure turbojets är bullriga och törstiga, och moderna krigare använder låga bypass-jetmotorer med blandade avgasflöden, som den som beskrivs ovan. Denna konfiguration tillåter fortfarande användning av efterbrännare: startsträcka är där höga bypass turbofans är särskilt starka.