För det här svaret kommer jag att klargöra två villkor för syftet med detta svar.
Ninja är en undertyp som "krigare". De tekniker som de använder kan inte ha något att göra med en klan eller något högre syfte.
Shinobi är en term som nästan uteslutande används för Shosuro Infiltrator i L5R-universum. De tjänar exakt en person: sin egen personliga herre som en del av klanen även om hon inte är direkt bekräftad.
Shosuro Infiltrators är överallt. De är ibland djupa undercover-agenter i förklädnad i motsats till en skuggig figur som skullar i svarta pyjamas (men de kommer också att göra det). De kan vara informationssamlare, mördare eller helt enkelt välplacerade resurser om deras herre vill vara upp till något. Men det är den viktigaste fångsten: De tjänar bara sin personliga herre. Oavsett olagliga uppgifter de ges, måste de utföra dem och lita på att deras herre har en större plan i åtanke. De behöver inte följa någon princip av bushido för att få jobbet, förutom för denna tillbakagång av lojalitet. De flesta Scorpion samurai är medvetna om att det finns agenter i fältet och huruvida shinobi i fråga är i linje eller mot sina planer kommer att bestämma reaktionen hos ens deras klänningar.
En ninja som de har rätt att döda direkt (även om det lätt kan vara oväntade att göra det) som en del av en lägre social kaste eller försöker använda som dubbelagent eftersom det finns en stark chans att de helt enkelt är en legosoldat till börja med.