Tremånadersregeln gäller för dem som anger Schengenzonen. Därför gäller det inte för dig för den här resan.
Tremånadersregeln är införd av Schengengrensningskoden i artikel 6.1 a, som ingår i kapitel 1, Korsning av yttre gränser och villkoren för tillträde. (Jag säger "tre månader" i stället för " 90 dagar "eftersom det är vad koden säger: " ... dess giltighet ska förlängas minst tre månader efter det avsedda avresedatumet ... ").
Du går inte över en extern gräns, så du går inte in i Schengenzonen, och den här artikeln gäller inte dig. Du borde därför inte ha problem med att gå ombord på flygningen.