Senate and most of government bodies were in the control of Palpatine...
Vanligtvis är denna typ av kontroll tuff och, när ledaren har fallit, ersätts lojaliteter av anhängarna av överlevnadsinstinkt. När det var defaced som en Sith, skulle hans stöd försvinna (föreställ dig att det är uppenbart att din lands premiärminister / präst har visat sig vara en psyko-mördare ... hur länge skulle han behålla kontrollen över sitt parti? ) Några av hans anhängare skulle vara verkligen chockade över att ha använts, och även de som kände till sin hemliga identitet skulle utgöra överraskning för att inte vara nästa.
Även om det var ett Sith, var det inte ett brott som var självständigt, att vara statschef för en republik i krig med ett uppror som offentligt stöddes av en Sith (Dooku) skulle ha varit tillräckligt för att göra mycket av ett fall. När länken i Palpatine med upproret hade upprättats hade frågan varit avgjort.Det sägs i filmen att det inte finns någon annan plan än "vi har just funnit att vår fiende är bakom oss, så vi måste reagera snabbt innan vi överträffas".