Av flera anledningar:
Först var SR-71 ett plan som aldrig var tänkt. En tidigare Blackbird-inkarnation, singelsätet A-12 hade varit i bruk i flera år med CIA under kodnamnet Oxcart. När slöjan av hemlighet lyftes och USAF upptäckte det krävde flygvapnet att vara ansvarig för strategisk flygupptäckt. Den interna politiken mellan DoD och Johnson-administrationen underlättade detta.
Flygvapnet uttryckte intresse för Blackbird för två uppdrag: först som en långväxande interceptor och fighter eskort för B-70 bombarprojektet i parallell utveckling vid den tiden och som ett snabbväxande flygplan med expanderad övervakning och elektronisk motåtgärder ombord. Båda roller skulle kräva en tvåpersoners besättning för att kunna driva systemen, vilket leder till ett längre flygplan med en andra besättning.
Blackbirds interceptorversion resulterade i YF-12A-prototypen som först flög 1963. Den innehöll en tvåpersoners besättning samt skurna näsanheter och en konisk näsa-radom för AN-ASG-18 brandstyrningsradar och identifieringsbåtar återställdes som vapenbåtar för att transportera AIM-4 Falcon-luften till flygroboten. Programmet avbröts till förmån för XF-108 Rapier-flygplanet, som avbröts tillsammans med XB-70.
Medan A-12 slutade sin livslängd och var tyst pensionerad till Palmdale och Area 51, skulle SR-71 ha en orimlig framgångsrik karriär med USAF trots blandade känslor med programmet bland toppmässan. Gen LeMay hatade blackbirden och kände att flygvapnet skulle spendera sina programdollar på bomber, inte på en hög underhållshastighetsdemon för rekognosering.
SR-71-programmet pensionerades officiellt under slutet av 1990-talet men under hela sin karriär försökte Lockheed sälja derivat av flygplanet till olika försvarsprogram. Lockheed skickade Blackbird-derivatdesign till F-X-fighterprogrammet, vilket blev F-15. Och tidiga inkarnationer av Lockheeds förslag till Advanced Tactical Fighter, som blev F-22, var baserade på Blackbird.