Problemet var verkligen en sifon, och det var faktiskt en mycket dum sak.
Vid avlägsnande av fyllningsröret märkte jag vattennivån på att det fanns på samma nivå som vattennivån i tanken. Men håll dig en sekund, varför skulle man se en vattennivå på fyllröret?
Det visar sig att vid något tillfälle, klämman som går ovanpå överflödesröret som ska hålla fyllningsröret förlorades. Röret under de senaste åren var bara gjutet i överloppsröret något. Det måste ha varit en störning i kraften eller röret på något sätt pressade sig ner efter alla dessa år, men när röret var under vattennivån sipprade det verkligen vatten från tanken genom påfyllningsventilen och in i skålen.
Jag tycker att detta borde ha varit det enklaste att fånga, men för framtida referens är lösningen att använda fyllröret.