Du ska få frimärken i det här fallet när du passerar från Kroatien till Slovenien. Enligt min erfarenhet har förfarandena vid dessa landgränser varit något avslappnade, men jag brukar korsa med bil snarare än med buss och jag har inte korsat det mycket sedan Kroatien gick med i EU. Jag korsade också utan visum. I ditt fall, med visum och buss, skulle jag förvänta mig att de skulle ge dig en frimärke självklart, som de borde.
(Du kommer säkert inte att få en frimärke vid gränsen mellan Slovenien och Italien eftersom båda länderna tillhör Schengenområdet. Därför är det ingen systematisk kontroll på den gränsen. Även om du är kontrollerad av någon anledning vann du få inte en Schengens poststempel eftersom du inte kommer in i Schengenområdet där.)
Din erfarenhet i Rom kan verkligen vara problematisk om du inte har en poststämpel. Om de slovenska officerarna inte ger dig en, bör du be om en.