När det gäller timing, se den här andra frågan . Mer generellt sett kommer ganska ofta flygplatser att lista föreslagna anslutningstider. München säger 45 minuter minimum för transitering om du är ändra terminaler, så fördubbling som borde vara ganska bekvämt.
När det gäller ditt bagage - förväntar jag mig att de ska kolla ditt bagage och för att du inte behöver se det igen tills du kommer till Kanada. För din egen sinnesro, dubbelkryssa bara när du checkar in. De borde kunna märka hela vägen till YOW.
Du kommer behöva hämta den på YYZ, och returnera den för att sättas på ditt anslutande flyg efter clearing av tullen.