Jag tror att du har två helt separata problem som du blev medveten om samtidigt, och som för det mesta inte är relaterade.
Felaktigt inställda system- och lufttryck i blåsertankar.
En anteckning - ju högre systemtryck, desto mindre vattenlagring (lossning) i en blåstank. Så du kan få bättre prestanda från en inställning på 40/60 eller 30/50.
Du kan också skada blåsorna genom att fylla luften till det tryck du har satt på vattensidan. Blåsan blir mycket mer distanserad än den är avsedd att vara och mycket vatten sitter helt enkelt i tanken, med den effektiva volymen av tanken kraftigt minskad, eftersom det första vattnet som kommer in i tanken ökar sitt lufttryck från din för låga inställning till där tryckbrytaren är inställd och krympande luftbubblan gör det.
Lågt tryck på badrum på andra våningen är förmodligen från ett blockage.
Tryck på grund av höjd är 2,3 fot per PSI, så trycket på andra våningen på grund av höjd är förmodligen inte riktigt problemet (kan vara 8-10 PSI mindre än källaren i ett typiskt hus) och det fungerade bra tills du tömmer systemet; så det är inte "riktigt" tryckförlust, i betydelsen av trycket i rören - IMPE är det ofta så att när du dränerar och fyller på ett vattensystem "crud" (vanligtvis ofarligt men obehagligt, avlagringar från vattnet) i rören slås loss med alla bubblor som passerar genom och kommer att ansluta duschhuvuden och luftare - det medför tryckförlust ut av duschar och handfat. Försök ta bort duschhuvuden och luftare, rengör dem och blås rören utan att ha dem på plats.
Jag föreslår att du dränerar systemet igen och kontrollerar att lufttrycket fortfarande är 38 (om du inte har en läckande urinblåsa) och återställ tryckswitchen till 40/60 (med en typisk tryckbrytare, var noga med att vrida Pumpbrytaren är avstängd innan du justerar.) Ta sedan bort alla duschkoppar och luftare, repressurera systemet och släck rören innan du installerar de rengjorda duschhuvudena och luftare igen.