Jedi vid templet hade en enorm nackdel. Den mest skickliga Jedi var utomjordiska strider som ledde klonarmén och de som var kvar på Coruscant var de unga, de äldre, några vakter, olika templets personal (bibliotekarier, tekniker, skivare och liknande) och några rådsmedlemmar som var Det är inte i byggnaden när attacken hände.
När Order 66 gjordes, blev Jedi systematiskt gjutit ner över galaxen under några minuter. De som levde kvar verkar lida av någon form av Force-relaterad chock vid förändringen i kraftens balans från ljus till mörk. Utöver det är klonerna inte egentligen onda, bara följa sina order dispassionately:
With the Jedi Order overextended, spread thin across the galaxy, each Jedi is alone, surrounded only by whatever clone troops he, she, or it commands. War itself pours darkness into the Force, deepening the cloud that limits Jedi perception. And the clones have no malice, no hatred, not the slightest ill intent that might give warning. They are only following orders.