tl; dr: Wade fick injiceras med lite blå gunk för att aktivera sin mutation, Vanessa gjorde det inte.
Wade fick inte sina mutantkrafter aktiverade enbart genom att vara i Punchbowl. Om det bara var mycket stressat var allt som krävdes för att utlösa mutationer då mycket skulle fler människor ha dem. (Att vara i Punchbowl är hur människor med KOL känner sig ganska mycket hela tiden.)
När han anlände först injicerade Ajax honom med ett serum som var konstruerat för att aktivera latenta mutanta krafter. Det var först efter det att detta serum var aktivt i kroppen som de fortsatte att påverka ämnena, för att utlösa mutationen.
Vanessa hade aldrig utsatts för vapnet X-serumet, så att spänningen i O2-kammaren inte utlöste någon latent mutation.
Det är också möjligt hon har inga mutanta gener i denna kontinuitet. Jag är ganska säker på att Ajax nämner att massor av vapen X-personer dör precis innan de muterar. I så fall kunde hon vara i kammaren i flera månader utan någon effekt. Självklart skulle detta vara en avvikelse från serierna, och skulle innebära att de inte kunde använda henne som Copycat i framtida filmer, så det är inte så troligt, men det är fortfarande möjligt.