Nej
Vad gäller kanon är allt vi behöver fortsätta innehållet i själva filmen. Ingen orsak till universum gavs för det för de mycket drastiska förändringarna i Evies utseende och persona.
I Matrixrevolutioner (som du refererar till) var Oracle ett program och det var något som lätt utnyttjades för att förklara förändringen i utseendet.
Evie är dock en kött-och-blod-människa. Det är sant att det finns olika övernaturliga krafter på jobbet i Mummy -trilogin, men inga överklagningar gjordes för dem som ett sätt att förklara Evies förändringar.