Det skulle finnas kvarvarande syre från tiden innan solljuset blockerades. Utan solljus och växter skulle de flesta syreförbrukande livsformer på jorden ha försvunnit inom några veckor, om inte dagar, vilket inte är tillräckligt med tid att tömma en betydande andel av den 20% syreatmosfär som vi tycker om.
Maskinerna skulle ha tagit hand om människorna och deras syreförbrukande industrier. Naturlig oxidation skulle gradvis ta ut syre ur atmosfären, men matrisen är förmodligen inte gammal för att processen ska ha gjort luften andas.
Du kanske frågar vad som händer när syre förbrukas av människor som är anslutna till matrisen. Detta plotthål är relaterat till plotthålet om livskraften hos mänsklig bioelektronik. Det enda svaret vi har är att det är "kombinerat med en form av fusion".