Does den kyberkristall som används i en lightsaber har en effekt på användaren?

Inte på något väsentligt sätt. Det är faktiskt bara motsatsen. I nuvarande kanon påverkas kristallen av användaren.

I novellen Ahsoka tar hon kyberkristallerna från en inkvisitorns ljuskärl och lägger dem i hennes hilter. De ändrade sedan färgen som svar på hennes förmåga.

Before she could even consider shouting a warning, the red lightsaber burst into a mess of noise and light. Bright spots pricked at her eyes, and then all was quiet. The creature wasn’t going to bother her anymore.

[...]

Kneeling beside her fallen foe, Ahsoka sifted through the wreckage of his lightsaber hilt. The crystals that had powered his lightsaber were no longer contained by metal, but their song had not dimmed. She held them in one hand, almost shaking as the familiarity of them coursed through her, while the other hand retrieved the half-finished hilts she carried with her.

[...]

Her mind’s eye sorted the preassembled components and those she had just retrieved into order, locking each into place with the others. When Ahsoka opened her hands, she was not surprised to find that two lightsabers, rough and unfinished, were waiting.

They would need more work, but they were hers.

When she turned them on, they shone the brightest white.
Ahsoka - Chapter 28

Nya hints på kristallerna är Ahsokas, vilket visar att trots att de hade fel för inkvisitorn, hade det inte någon märkbar effekt. Och när Ahsoka fick dem kunde hon "reattune" dem.

Star Wars-databasen säger:

A lightsaber crystal is colorless until first attuned and connected to a Jedi -- at which times it glows either blue or green or, in some rare instances, another shade. From that point on, it retains that hue.
Kyber Crystal | Star Wars Databank

Så all bevis pekar på kristallen är den enda som påverkas. Nu, då en kristall är anpassad till kraften och en förlängning av en kraftkänslig medvetenhet, är det troligt att det inte är någon nackdel att använda en kristall som inte är din (eller använda någon annans ljuskrona). Men det skulle vara mycket som att använda något vapen som inte var det du brukade använda.

Sammanfattningsvis: Kristallen kommer att fungera och det blir lite eller ingen effekt

Om kristallen inte är anpassad till användaren kunde han inte använda den till full effekt

Första exemplet är från comic Darth Vader: Dark Lord of the Sith del 1 . Jag kunde inte kopiera alla relevanta sidor här, men i grunden Palpatine berättar för Vader att hans gamla blå saber inte längre är tillräckligt bra för honom eftersom det var Jedi-vapen. I stället behöver han blöda Kyber-kristall och bygga en ny. Det är underförstått att han förlorade sin kamp mot Kenobi eftersom han inte längre var anpassad till vapnet.

Andra exemplet kan vara Luke Skywalker. Han använde för det första samma blå lightsaber (tillhör Anakin) men han var inte särskilt skicklig med den, förlorade kamp och hand vs Vader. Senare konstruerade han sin egen lightaber (green) med mycket bättre resultat (slå både Vader och Jabbas hantlangare)