En portugisisk medborgare kan i allmänhet inte vägras inresa till Storbritannien, och kan bo där för resten av sitt liv utan tillstånd (vilket kommer att ändras efter Brexit, men du kommer att behandlas enligt gällande regler).
Så ja, visa bara ditt portugisiska pass vid brittisk invandring.
Du säger också att du ansöker om dubbel nationalitet. Om du har både ett kenyanskt och portugisiskt pass, är du redan en dubbel medborgare.