En sak som hände mig när Kirk och huvudantagonisten har en konversation:
Khan says that Admiral Marcus needed his "savagery", or words to that effect, to realize his vision of a militarized Starfleet. Of course, in the original timeline, Starfleet already is very much a military organization, so there's something different here.
Inte bara är Starfleet unready för ett krig med Klingons, men Marcus tror att de i viss utsträckning är oförmögna att göra sig redo utan hjälp av mer krigsmatchade människor. Eftersom Starfleet av denna tidslinje främst är en fredlig rymdutforskningsorganisation, kanske det verkligen inte är inga -varningssystem.