Som @ Napoleon sa i sin kommentar, detta andra svar förklarar varför Skyler hade anklagelser mot henne.
Huruvida familjen rattade Walter ut? Jag skulle absolut säga. Hank försvinner, men vi vet att han berättade för Maria var han gick och så när Walt kommer tillbaka till huset och tar Holly, Maria, Skyler och Walt Jr. är alla utan tvekan tvivel om vad som hänt med Hank.
Även om Maria har blivit sjuk av Walt ett tag, är detta utan tvekan det sista strået för Walts familj. Kom ihåg att Skyler använder en kniv för att fästa honom och är synligt skräck av den här mannen hon en gång visste. Deras hat mot Walt förstärks när Walt försöker ringa Walt Jr. i skolan någon gång senare för att ge honom pengar. Walt Jr. har inget intresse och hyser att Walt tycker att han skulle bry sig om det.
En annan viktig person du inte nämnde i din fråga är Jesse. Han arbetade med DEA för att försöka få ner Walt - och den här operationen bara innebär att Hank och Gomez ingår.
Jag skulle säga att med både vittnesmål om Maria, Walt Jr och Skyler, i kombination med Ises tidigare hjälp hade de mer än tillräckligt med bevis för att föreslå Walt var drogkonstnålen.
När vi ser Skyler i sista episoden, är hon ett skal av vem hon var och har uppenbarligen förlorat nästan allt. Detta tyder starkt på att när DEA gjorde lite grävning var det lätt att hitta hur mycket pengar som tvättades i biltvätten - och uppenbarligen skulle detta starkt stödja sitt fall. Kom också ihåg att tidigare i serien gav Skyler en enorm utbetalning till Ted, eftersom hon inte ville att någon grävde genom familjen eller biltvättens ekonomi, eftersom de behandlade så mycket pengar var det ingen uppenbar väg att dölja det ( och så kunde folk inte titta för nära eller spelet skulle vara uppe).
Det var troligen den enda skälet att Skyler inte var mer inblandad var Walts aggressiva (och falska) telefonsamtal till henne, där han hotade henne om hon pratade med polisen, vilket var en sista "gärning" av Walt som han insåg hur mycket besvär hon skulle vara i.Såsom slutsats: de skulle verkligen ha rattat honom ut, och dea hade också bevis på Jesse och några bevis som de fann om penningtvätt vid bilvatten.