Som EU-medborgare har jag ingen personlig erfarenhet av detta, men de relevanta dokumenten (EU-förordningar, webbsidor från det rumänska utrikesdepartementet - det senare är tyvärr oftast ganska dåligt översatt) nämner inget krav på att komma in i Rumänien från Schengenområdet undantas från viseringskravet, men endast för att inneha särskilda visum eller tillstånd från ett Schengenland.
Min förståelse är att logiken bakom reglerna är att du måste vara en betrodd resenär / kunna återkomma till Schengenområdet för att få tillträde i Rumänien utan rumänsk visum (det är därför en singel post Schengen visum räcker inte). Din visum för flera inresor är ett gott bevis på det, om du redan använt det eller inte, så jag skulle inte vara oroad över att du kom in i Rumänien först.