Det har aldrig funnits någon officiell in-universförklaring som ges av någon som är associerad med det här avsnittet i synnerhet eller med Star Trek i allmänhet.
Det är emellertid ett problem som har diskuterats i år och år av Star Trek fans. Här är två fanatiska teorier i universum som har kastats runt i några decennier:
1. Atmosfäriska förhållanden förhindrade landning
Du har redan hänvisat till den här i din fråga. Även om det inte uttryckligen nämns i avsnittet, kan det hårda väder som utvecklas runt Sufels landningsfest ha varit en del av större atmosfärstörningar. Pilot genom atmosfären kan ha varit omöjligt.
2. Det fanns inga shuttles
Kanske fanns det inga shuttles och Shuttle Bay var avsedd att användas främst för att ta med besökande shuttles ombord istället för att distribuera shuttles som tillhör Enterprise, delvis på grund av hur pålitlig transportören hade blivit 2265. Det kan vara att Händelsen i "The Enemy Within" ledde faktiskt till en begäran om en uppsättning Starfleet-shuttles att vara permanent placerad på Enterprise, vilket leder till användningen av en i "The Galileo Seven".