Enkel version : Den faktiska fantomstriden var den enda Palpatine / Sidious skapad enbart för att ta över senaten.
Poängen, och med namnet Phantom Menace understryker bara det, är att hotet mot Naboo kan vara verkligt, men det är sekundärt för Palpatines verkliga mål, vilket är att få Naboo att känna sig hotad ( eller hotad) så det var lätt för Palpatine att manipulera senaten att göra vad han ville.
Mer i djupversion : Sedan Palpatine kontrollerade separatisterna (jag inbegriper Trade Federation med dem) genom Dooku (utan att någon vet det) kunde han beställa en blockad runt Naboo. Eftersom det var hans egen hemvärld, skulle det också hjälpa till med framträdanden när han visade extra bekymmer för att hjälpa till att bryta blockaden.
Hans hela mål var att Amidala skulle hävda sig framför senaten och att det fanns tillräckligt med sympati för hennes sak (och han var från samma planet gav honom också sympatipoäng) att när hon bad om hjälp och kansler Velorum kunde bara ge sin standard retorik, senatorer skulle vara bakom henne när hon flyttade för en missförstörelsestilldelning.
Hela hans mål var att sätta Amidala i ett så sårbart läge att folk skulle stödja henne när hon bad om en osäkerhetskamp. Då, när det skedde, skulle det vara lätt för honom att manipulera sympatiet och ta ställning till röster för att välja sig som kansler.
Medan han var intresserad av Naboo, var det inte så viktigt som att bli kansler, vilket skulle ge honom möjlighet att slutligen ta kontroll över senaten. Trots att Palpatine hade andra planer för Naboo, var det viktigaste problemet i senaten.