Episodens huvudtyp handlar om en koloni av folk som heter mariposaner som helt och hållet består av kloner från de ursprungliga 5 överlevande av en kraschlandning. De har undvikit all "naturlig" reproduktion och som sådana upplever en process som kallas "replikativ fading" där varje kopia av genetiskt material bryts ned från föregående kopia. Mariposerna föreslår att kloner Riker för att injicera nytt genetiskt material i sitt samhälle. Han avböjer.
Samtidigt har Enterprise-besättningen kommit över en koloni av människor som letar efter ett nytt hem. Under kursen samtycker de båda samhällena att gå med ihop. Klon samhället behöver en stor grupp av nytt genetiskt material (men erhållet på den "naturliga" sätten, och den andra gruppen behöver ett nytt hem.
Titeln då är "Up the Long Ladder" en referens till DNA: s molekylära, dubbel-helixstruktur:
EftersomDNAärettunderliggandetemaförepisoden.ObserverahurstrukturenavDNAliknarenstege.
Dessutomärkoloninavmänniskorsomsökeretthemostensiblynedstämdfrånengruppirländskakolonister.Detfinnsförmodligenenirländskfolksångsominnehållerorden"Upp den långa stegen, längs det långa repet", men den sångens tema är i allmänhet inte relaterad till temat för episoden. Denna information hänvisas till i Memory Alpha-artikeln, men det finns ingen hänvisning till någon produktionspersonal eller element som skulle indikera att detta var en avsiktlig referens.