Jag tror att detta kommer att hamna lite spekulativt, men jag tar ett skott när jag svarar på det här. Som jag nämnde i en kommentar och sade att Dobby förrådde sin mästares planer på Harry är inte helt korrekt. Dobby berättade inte för Harry vad Lucius Malfoy planerade, bara att Harry skulle vara i fara om han återvände till Hogwarts. Så, varför skulle han göra det?
Harry, och läsaren, lär sig tidigt i den första boken som han är, inom trollkarlen, otroligt känd. Inte bara är han känd, men han är känd för en av de viktigaste händelserna i den senaste historien - Voldemorts nederlag. Det kan räcka för att Dobby vill hålla honom levande och varna honom då han kommer att sätta sig i en extremt farlig situation.
Lucius Malfoy var en av Voldemorts mest lojala och betrodda anhängare. Viktigt nog att ha fått anförtrotts en av hans horcruxer, även om han inte visste det var vad det var (Voldemort kommer inte att dela det oavsett hur mycket han litar på någon). Vi kan på ett säkert sätt anta att han också hade varit betrodda med Voldemorts hemligheter, som vad han visste om profetian om Harry och Voldemort.
Med tanke på vad vi vet om Malfoys inställning till House elves, kommer de inte troligt att ta mycket märke till Dobby om han är närvarande när de diskuterar viktiga saker, till exempel planer på att öppna om Secret of Secrets eller ovannämnda profetia. Visst är det spekulation, men jag tycker inte att det är orimligt att tro att Dobby skulle ha kunskap om många av dessa saker.
Om vi arbetar med antagandet att Dobby känner till profetian, då kommer han att veta att Harry inte bara är viktigt för vad han gjorde som en bebis, men vad han kommer att göra i framtiden. Det verkar som en mycket bra anledning att vilja hålla honom säker och borta från skada på mig. Särskilt om du anser att husälvens liv sannolikt blir mycket värre om Voldemort skulle återvända och ta kontroll.