Materia / Antimatterförsamlingen är "nyckel".
Mitt svar är baserat på Enterprise D och kommer från den officiella Star Trek: Tekniska manualen för nästa generation av Michael Okuda och Rick Sterbach (de två huvudproduktionsdesignerna på TNG em>). Jag antar att det här svaret gäller för de flesta TNG - Starfleet-designade rymdskepp, inklusive Enterprise E och möjligen Enterprise C (två decennier före D).
Enligt manualen (avsnitt 5.2 om materiel / antimatterförsamlingen) är startkörningen för motorn vad som "slår på" skeppet i allmänhet.
As the entire engine system undergoes start-up, the energetic plasma generated...
... fördelas över skeppet via PTCs (strömöverföringsledningar). Effekten är åtkomst av olika inbyggda system med hjälp av EPS (elektro-plasmasystem) reläer, som har tre typer av kraftkranar, beroende på system eller enhet som drar energi från reläet. (Jag har fått parafrasera ett par sidor värt technobabble.)
Grundläggande, motorinitiering via materia- / antimatteraggregatet styrs via Engineering. (Det kan moduleras från bron, men om EPS-reläerna och kraftdistributionsmanövererna inte har någon ström att distribuera, kommer Bridge-system att vara offline och en "cold start" direkt från Engineering krävs.)
När det gäller hur fartyget är påslaget ("knapp, fob, spak ...") måste man förmodligen fysiskt öppna intermixkammaren mellan materia och antimaterium och låta materia och antimateria blandas (förutsatt att vi försöker helt "kallstart" där alla konsoler inte fungerar). Detta beskrivs inte i manualen, men det verkar rimligt för mig.
Obs! Vi ser Enterprise D helt "av" i avsnittet " Starship Mine " för en baryon sweep, men vi är inte uttryckligen visade geninitiationssekvensen.