Vi vet inte.
Vi ser inget av magiska ministeriet i bok 6, vilket är den tidsperiod du frågar om. Mitt bästa gissning är att det förmodligen togs bort eftersom Dumbledore säger att det var "förstört" under kampen i Atrium.
"The fountain we destroyed tonight told a lie. We wizards have mistreated and abused our fellows for too long, and we are now reaping our reward.”
(Order of the Phoenix, Chapter 37, The Lost Prophecy).
Varför säger han förstört jag vet inte. Två av statyerna drabbades av Avada Kedavra. Men jag hade trott att det inte skulle bli något lite Reparo inte kunde åtgärda. Men kanske var fontänen bortom magisk reparation av någon anledning. Eller kanske ministeriet bestämde sig för att ersätta det med något mer lämpligt som det var nu huvudkontoret för kampen mot Death Eaters. Allt vi vet är att genom Deathly Hallows är fontänen borta.
Previously a golden fountain had filled the center of the hall, casting shimmering spots of light over the polished wooden floor and walls. Now a gigantic statue of black stone dominated the scene.
(Deathly Hallows, Chapter 12, Magic is Might).
Vad som hände med det förblir ett mysterium.