I artikeln om episoden nämner du ( Force of Nature ) det anges (i "Kontinuitet" ):
According to the unpublished VOY Season 1 edition of the Star Trek: Voyager Technical Guide, by Rick Sternbach and Michael Okuda, it was suggested that because of the variable geometry pylons, warp fields may no longer have a negative impact on habitable worlds as established in this episode.
Tanken var att när Voyager gick in i varp och varpbubblan bildades skiftades varpmotorerna; och detta enda skift (vid bildandet av varpbubblan) ändrade karaktärens karaktär så att det inte längre skulle skada delrummet.
Så det var inte den slutliga positionen hos nacellerna som hindrade skada på delrummet eftersom det var rörelsen under bildandet av varpfältet, vilket förändrade bubblans natur som omger fartyget.