På grundval av igår kvälls SHIELD-agenter verkar det som om Theta-protokollet hade att göra med Helicarrier som lagrades i en okänd SHIELD-bas. En av bröderna Koenig körde basen för Coulson och Fury.
Så jag antar att Theta var redo, Coulson informerade Fury om att bäraren var redo att bli spelad om det var nödvändigt.