Du kan kan ersätta bara tröskeln. Ibland är det svårt eftersom det ursprungliga tröskelvärdet skruvas ihop som en del av en komplett montering, eller den ligger under dörrstoppet av jambs, men det låter som om du redan tänkte ut den delen.
Jag skulle vara försiktig med att undersöka och åtgärda det som orsakade vattentäthetet (om det fanns en extra fråga förutom den gamla tröskeln) och reparera eventuellt skadat trä nedanför innan du installerade det. Jag antar att din nya är aluminium eftersom du nämner att du fyller den med sprutskum, skruva ner det bra med rostfria skruvar. De skruvar som följer med dem är inte alltid de bästa som ska användas.