Som jag har sagt någon annanstans på den här webbplatsen finner jag ingen spänningstestare för att vara opålitlig. Jag har sett både falska positiva och falska negativa med min, särskilt i närvaro av flera ledare, varav några är heta. Det enda jag skulle använda en spännings tester utan kontakt är att bekräfta ett tillstånd som jag redan vet, och även då skulle jag bara använda den för att testa om en hel krets är levande eller inte, inte enskilda ledare.
Om du får förvirrande avläsningar är det första som jag skulle göra att använda en riktig multimeter för att få pålitliga spänningar, då kan du gå därifrån.
Men för att svara på din fråga: nej, bör GFCI inte vända polariteten i kretsen. Är du säker på att du använder WFC-enheten korrekt? De flesta (alla?) GFCI-uttagen har olika terminaler "LINE" och "LOAD", som du använder?