För förklaringar i universum har den förmodligen en liknande logik till DS9 / First Contact uniform-förändringen, att den bara är mer "militaristisk" och reflekterar en förändring i tankesättet. Samma sak gäller uppdaterade tricorder- och phaser-modeller.
På vissa sätt kan man argumentera för att det blåa är något mindre distraherande, och minskningen av olika färger ger specialiserade färger (som rött) en större betydelse. Detta är en faktisk designprincip, men en sträcka i detta sammanhang.
Medan informationen definitivt saknas, misstänker jag starkt att förändringen hade att göra med både att komplettera den aggressiva färggraderingen av filmen och att bättre se på de nya LCD-skärmarna som ersatte CRT-rekvisita.
Trots de många fördelarna med LCD-skärmar, syns "svart" ganska mycket som en mörkgrå jämfört med en CRT-bildskärm, och denna bieffekt är uppenbar i hela filmen på alla animerade bildskärmar. Hade de behållit de ursprungliga färgerna, tror jag att de skulle uppträda märkbart snedvridna, vilket gör en planlösning omedelbart desto mer nödvändig.
Vad beträffar 3D-knapparna kan det hävdas att det är helt enkelt mindre distraherande att ha den typen av "inbäddad" utseende. Jag gissar också det stora mjukvaruutvecklingsskiftet med Mac OS X och dess fina 3D-utseende gav inspiration till det.