RAW
Hunter's Mark kan tillämpas på mer än ett varelse åt gången men bara med något som Sorcererens Twinned Spell Metamagic klassfunktion.
I annat fall kräver Hunter's Mark koncentration och du kan inte koncentrera sig på mer än en stavning åt gången (PHB s. 203) så att du normalt inte skulle kunna tillämpa den på en andra varelse.
Som en strikt läsning av Ocherjellyens Split beskrivning och som Miniman påpekar splittras det i två nya och separerar Jellies så att alla effekter på originalet blekna in i äther och appliceras inte på någon av de två nya -en.
Vad du kan göra istället
Eftersom DM du har frihet att böja / bryta reglerna som du tycker är lämplig för att göra spelet mer underhållande och jag skulle säga i en sådan situation skulle det vara ett rimligt samtal att göra det.
Anta att datorn kan upprätthålla koncentrationen, och tillåta att Hunter's Mark fortfarande bara tillämpas på en Jelly när den splittrar inte kommer att bryta någonting eftersom du kan ändra stenbrott när du släpper din nuvarande till 0HP ändå. Du kan till och med lägga till en konstitution sparande kasta för att behålla koncentrationen när splittringen sker för att simulera förändringen i varelsen som har en negativ effekt på stavningen. Genom att göra så kommer denna avgörande närmare RAW och ger spelaren en chans att inte slösa bort resurser på grund av att reglerna strikt överensstämmer.
Detta kan också hjälpa spelaren att känna sig mindre lurad om de bara nyligen gjuter Hunter's Mark före splittringen och om Jelly har hög nog HP kvar efter splittringen för att det ska fortsätta användbara.