I framtida förflutna dagar skickar Magneto och Xavier, med hjälp av Kitty Pryde, Wolverines medvetenhet tillbaka i tiden till 70-talet för att ändra historien.
Han lyckas och skapar en ny tidslinje.
X2 ligger i den ursprungliga tidslinjen. Apokalyps är inställd på den här nya tidslinjen.