Om man betraktar det aktiva kontrollrummet som "mitt" på fartyget, liksom det mest utrymme där de flesta viktiga händelserna inträffar, är det logiskt att alla objekt som landas på / runt skulle visas där som standard.
IIRC, första gången någonting landades på var Logopolis, där TARDIS landade kring vad som antogs vara en vanlig polislåda för att ta många komplexa mätningar. Det var inte vanligt, och det resulterade i många komplexa konfigurationer.
Efter att ha sagt det skulle jag anta att om inställningarna ändrats kunde ett objekt ställas in för att visas i valfritt rum eller plats. Om det var en fientlig alien, kunde de landa kapseln så att de skulle dyka upp i ett låst rum långt bort från kontrollrummet.