Du har fel det är inte väte, det är kväve som är dominerande i atmosfären, vilket betyder att nitrogren och syrekomponenterna är ganska lik Jord (78.09% kväve, 20,95% syre ).
Den angivna orsaken i filmen för varför människor inte andas är den höga koldioxidhalten, som vid över 3% är betydligt högre än jordens (0,039%, så det är nästan 100 gånger högre):
Janek: What is the atmosphere?
Ravel: Atmosphere is 71 percent nitrogen, 21 percent oxygen, traces of argon gas.
Janek: Whoa, now, that's weather.
Charlie Holloway: Just like home.
Ford: Only if you're breathing through an exhaust pipe. CO2 is over 3 percent. Two minutes without a suit, you're dead.
Ingenjörerna uppenbarligen därför andas en liknande kväve / syreblandning till det som vi gör, men har högre tolerans för koldioxid.
På en intressant sidotikett, och som noterat i den här frågan , kol dioxid i filmen är ett uppenbart fel: koldioxid i den koncentrationen är inte så giftig, och det är heller inte orsakat av en utblåsning; kol monoxid är vad det självklart borde vara.
Att ingenjörerna kan ha ett biologiskt krav på att andas en sådan hög nivå kolmonoxid (eller dioxid) kan diskonteras. Atmosfären inuti sitt skepp var andningsbart av människor (som scenen i kontrollrummet - där människorna är utan hjälmarna - bekräftar), så tydligt är deras föredragna atmosfärblandning något som andas av människor, dvs icke-dödligt för oss. Dock överlevde den överlevande ingenjören det från sitt skepp till livbåten utan hjälm, så de verkar ha högre tolerans för en blandning som skulle vara dödlig för människor.