Du frågar specifikt om Kirk och Spock, men jag tror på den här frågan vi kan betrakta matvanor från andra shows, liksom de är alla samma universum och några är inte så långt på universums tidslinje från varandra.
Vulkaner är vegeterians, eventuellt veganer
Det är en del av deras anti-våldsfilosofi. Detta anges mer än en gång av T'Pol i "Enterprise" -serien. I en episod (förlåt, kan inte hitta namnet) när hon beställer skräpmat på jorden frågar hon:
Does the Fiesta salad contain animal products?
Vilket innebär att hon förmodligen är vegan.
Eller T'Pol igen:
You humans claim to be enlightened, yet you still consume the flesh of animals... You remain impulsive carnivores
Även Vulcan mat är ganska smaklös ur en mänsklig synvinkel, som förmodligen också hänvisar till deras kultur att vara mer produktiv, mindre känslomässig om vad du gör (konsumerar).
Vi ser vanligtvis att icke-mänskliga medlemmar av besättningen har möjligheter att följa sina kulturella preferenser i mat (T'Pol håller på att vara vegan, sju äter är enkla, B'elanna får ritualiska Klingon-diskar när det behövs) och vi är redan införda till Plomeek-soppa som en av Spocks favoriträtter i TOS. Så antagligen Spock äter vad som helst som motsvarar hans smak och matvanor.
Här är en Plomeek-soppa för att hålla Spock glad:)
Mänskligabesättningsmedlemmarföredrarsammamänskligamatochdrycksomvigör
Bortsettfrånspecifikatillfällennärdetintefinnstillgängligt,äterbesättningsmedlemmarpåEnterprisenormalmat-kött,fisk,pajer,grönsaker,kakoretc.Detproducerasoftastavmatreplikatörerfrånnågontypavreplikatorgel.Dettagörmatsmakenrimlig,menintebra.Ändåärdettillräckligtmednäringförattfungerasomenkonstantmatförsörjning.
Poängenhärärattderasmatvanorärdesammasomvibrukar.Ävenomdetillverkasavettgeltillskottansermänniskorfortfarandeattmatskaseochsmakasom"normal" mat.
Detta visas i detaljer i "Voyager" . Kapten Janeway är kaffemissbrukare, Seven of Nine föredrar te, men hon upprepas av andra karaktärer för att replikera en mängd olika livsmedel för att njuta av smaken (som tydligen är vad andra gör) organiserar Kes hela processen att groving sina egna grönsaker till kock (för riktig mat, som sagt, smakar bättre och sedan replikeras). Och det är hela stor historia med Neelix som kock för att ge besättningen olika hjemmelagda rätter. Så igen ser vi att matvanor i laget är ganska normala - ingen förväntar sig att de ska äta en näringspasta från rör eller oidentifierbara kosttillskott.
Sinnsaken, att "Voyager" äger rum inte mycket senare efter TOS, så antagligen Star Fleet-medlemmar brukade normal mat under hela Star Trek-tidslinjen.
De dricker alkohol
Det finns många tillfällen i alla showen när skeppsmedlemmen dricker alkohol, jag kommer inte ens försöka hänvisa dem alla. Det är uppenbarligen inte begränsat (om du inte är i tjänst, säkert).
Så hur är det med de konstiga färgade kuberna i TOS?
In-Universe : Vi vet att de har replikatorer (kallade synthesizers i TOS) som kan producera mer än bara färgade kuber. Vi ser Kirk beställer kycklingmacka och kaffe i avsnittet Trouble with Tribbles . Så äter de egentligen normal mat förutom de kuberna.
Man kan tro att replikatorer aka synthesizers ännu inte är utvecklade nog för att ge alla de olika mat vi ser i senare visar, men det kan inte vara fallet. Vi ser att de redan använder replikatorer på Discovery (i Star Trek: Discovery ) och det finns inga roliga kosttillskott. Och Discovery äger rum 10 år före TOS, så tekniken borde ha utvecklats korrekt då.
Utanför universum : I TOS försökte de förmodligen skapa en futuristisk atmosfär med hjälp av denna förenklad matbit. Det är också allmänt känt att de låg på budgeten på set.
Sammanfattningsvis
Så i allmänhet på ett Star Fleet-skepp Vulcan äter vulkan mat, människa äter mänsklig mat. Även i TOS indikeras att det finns möjligheter för Enterprise att tillhandahålla dem för Kirk och Spock. Frågan om de färgade kuberna förblir öppen (kanske smakar de bara bra?), Men jag är rädd att förklaring till utelämnandet verkar vara korrekt här.