Jag skulle säga att Armor of Agathys fortfarande skulle träda i kraft - beskrivningen säger om en varelse träffar dig med ett melee-vapen, inte skador du. Det finns en mängd olika effekter som kan mildra skadorna som inte hindrar det från att bli en hit i första hand.
Detta gör också i spel-världen-sinnen; stavningen slocknar förkylning som gör ont för dig och ditt utseende; den tunga rustningens mästareförmåga låter dig skaka av attacker som slår på din rustning, så det finns ingen bra simulatorisk anledning att förkylningen inte heller skulle påverka attacken.